16257   16265         16427
56789012345             7890
CCCCACCCAGA-------------GGTACTGGGGTG
      CCAGA
      C-AGA
 CCCACCCAg
 CCCACC-AG
  ......ooXXXXXXXXXXXXXXXoo......
09876543210             01234567890
CCC                     GGTACTGGG-
CC-                     GGTACT-GGG
-CC

  
GGTACTGGGGTG
     T-
     
     
          18374   18498
45678901234       890123456
CACAACTCAGG-------GGTAAGGGGGGGC
  ......ooXXXXXXXXXoo......
09876543210       01234567890
 Axx   Cxx          Tx
 
          18819  18826
901234567890123456789
CCCCTTCCAGGTCTTCAGGGA
       CAGGTCT   A
  ......ooXXXXXXXXXoo......
          0123


          19029         19274
CTCTCTGCAGGTGGCCAGG
       CAGGTG---AG
       CAGGT---CAG
       CAGG---CCAG
       CAG---GCCAG
  ......ooXXXXXXXXXoo......

           19030
          GTGGCCAGG
          -V--A--R-
           509
          GTG---AGG
          -V-----R-

          GT---CAGG
          -V-----R-

          G---CCAGG
          -V-----R-

       19026

            V   A   R
       cagGTG.GCC.AGg
       cagGT-.--C.AGg     V-R
       cagG--.-CC.AGg     A-R
       cag---.GCC.AGg     A-R