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samtools index /mnt/wigstore6/user/kendall/wigstore2/nla3_155/<BARCODE_GROUP>/<SEQ_UNIT_ID>.r1.ucsc.hg38.bt1_hg38.sorted.bam

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samtools index /mnt/wigstore6/user/kendall/wigstore2/nla3_155/<BARCODE_GROUP>/<SEQ_UNIT_ID>.r2.ucsc.hg38.bt1_hg38.sorted.bam